1.胃肠道动力紊乱
IBS患者小肠消化间期移行性复合运动异常，周期明显缩短，空肠出现较多离散的丛集收缩波，且腹痛发作者中多数与之有关，这些变化在应激和睡眠中更为明显。
2.内脏感觉异常
研究发现IBS患者多数具有对管腔(直肠)扩张感觉过敏的临床特征，其平均痛觉阈值下降，直肠扩张后的不适程度增强或有异常的内脏-躯体放射痛，提示脊髓水平对内脏感觉信号处理的异常。
3.精神因素
心理应激对胃肠道功能有显著影响，它在IBS症状的诱发，加重和持续化中起重要作用，相当一部分患者伴有心理障碍，其中以焦虑，抑郁为主。
4.肠道感染
部分IBS患者在发病前有肠道感染史，在由各种病原(包括细菌，病毒，寄生虫)感染引起的胃肠炎患者中有部分发生肠功能紊乱，有10%可发展为感染后IBS。
5.其他
部分IBS患者的症状与食物有关，可加重其症状，食物中的纤维发酵可能是过多气体产生的原因，此外，肠道菌群的紊乱可能也是产生症状的原因之一。
一、经常放松心情，多做深呼吸，多外出走走。精神状态与肠道症状密切相关，医务工作者要以同情和负责的态度向病人解释疾病的性质和注意事项，应解除病人许多疑虑的心态，使其消除恐惧，提高战胜疾病的信心。必要时应用镇静、抗抑郁治疗。
二、生活饮食注意，少吃对肠胃刺激性较强的东西。饮食选用易消化、少脂肪，禁食刺激性、敏感性食品。对便秘、腹胀者，可适当多吃些富含纤维素，但不易产气的饮食，避免过食及零食。以腹泻为主的患者，应少吃含粗纤维的食品。
三、服用一些对调整肠道菌群比较有效的药物，虽可减轻症状，但不能预防复发，故应合理用药，并避免滥用药。
多次(至少3次)大便常规培养均阴性，便隐血试验阴性，血尿常规正常，血沉正常，对于年龄40岁以上患者，除上述检查外，尚需进行结肠镜检查并进行黏膜活检以除外肠道感染性、肿瘤性疾病等。
